Notre projet vise à identifier le lien entre les signatures précoces du microbiote intestinal chez les grands prématurés et la maturation de l'intestin, des poumons et le développement de l'immunité qui est déséquilibrée dans plusieurs maladies telles que l'allergie. Ceci sera évalué en utilisant des souris gnotobiotiques : des souris nouveau-nées sans germes, colonisées par différents microbiotes fécaux représentatifs des divers profils bactériens identifiés chez les grands prématurés grâce à l'étude EPIFLORE (ANR12-BSV3-0025). Après cette colonisation primaire, ces microbiotes seront autorisés à se diversifier au fil du temps (Figure 1).
Au cours de ce projet de 2 ans, nous prévoyons d'abord d'étudier l'impact du microbiote du premier mois sur la maturation des écosystèmes intestinaux et pulmonaires et sur l'immunité au cours du temps jusqu'à l'âge adulte (c.-à-d. 6 semaines) au niveau local et systémique. Deuxièmement, nous étudierons l'impact de la colonisation du microbiote du premier mois sur le développement des allergies.) Ces données seront essentielles pour étudier l'impact des probiotiques/prébiotiques pendant la colonisation primaire afin de prévenir les conséquences à long terme.
La première année a été consacrée au WP1 : Impact de la colonisation prématurée sur la maturation intestin-poumon et l'immunité avec deux objectifs : (1) Caractériser la maturation de l'intestin, du poumon et de l'immunité en présence de M3 ou M5 ; (2) Evaluer la résilience (ou non) de M3 et M5 après la diversification du sevrage et son impact. Le sevrage a un impact majeur sur le développement de l'immunité, en relation avec le microbiote. Il s'agit de la première étude sur la capacité de la diversification au sevrage à corriger les effets d'une dysbiose précoce.